陈干从辽阳脱险后,1907年秋再赴日本,后带着使命返回青岛。陈干和刘冠三等租借了胶州路的一所房子,于1908年2月成立震旦公学,陈干任校长。陈干聘任的教员多为革命党人,他们组织学生游行示威,抗议德国侵占我路权矿权,要求权力归还。震旦公学的声势越来越壮大,因保矿事惹怒了胶澳租借地的德国当局,所以清廷借机勾结德人抑制震旦,德人强行令陈干离开青岛。
向德国官员力争,租房创办震旦公学
　　陈干从辽阳脱险后,1907年秋再赴日本,与同盟会领导商讨革命大计。1907年冬,陈干带着使命返回青岛,以山东同盟会主盟人的身份,倡议在青岛创办震旦公学,以此做为革命机关,得到党人的拥护。
　　陈干初到青岛时,因没有发辫,又穿制服,出入很不方便,受到友人吕子人颇多照顾,吕子人精计算,治办西人建筑工程,交纳豪士,闻干洞论时事,疑其康、梁党也,干曰:“康、梁何足道?必欲救中国,非革命党不可。革命党者,孙文为之率。”因出《天讨》示子人,子人曰:“然则君其革命党乎?”干曰:“革命余本能,余有志焉,君亦有意乎?”据吕子人回忆,当时陈干向他宣传吴樾炸五大臣,徐锡麟刺杀恩铭等英雄事迹。在革命精神的感召下,吕子人毅然加入了同盟会。
　　在这之前,山东同盟会员创办的学校,以烟台的东牟公学和济南的山左公学规模最大。刘冠三在济南办山左公学,传播新思想,呼吁革命,因活动过烈,于1908年初被清政府查封,刘冠三被缉拿,逃亡青岛,与陈干协办震旦。
　　当时青岛属德国租借地,陈干等人要求办学立案时,遭到德国殖民当局拒绝。陈干义正严词地质问道:“对妓院你们可以立案批准,建学校却不行,难道你们大德意志是器重妓院而轻视学校吗?”这一问使得德国官员无话可说,只得批准。他们租定了胶州路的一所房子,1908年2月,震旦公学成立,陈干任校长。临时经费由吕子人担任,刘冠三负责四处募捐,以智力劫取清廷官款、贪污赃款、盐商侵蚀款及奸民贩运毒物款,凡不义之财,必输入公学。革命党人取“震旦公学”为校名,即是振兴中华之意。章太炎从日本给陈干来信,积极支持:“知青岛大有可为,喜极。”“请张继至青岛讲社会主义。”
教授军事和国文,组织学生游行示威
　　陈干负责聘请教员,并亲自前去日本,据景定成回忆:“……一天,山东来了两个人,就是陈君干和商君震,说他们要在青岛创办震旦公学,请我去当教员,我立刻承应了……不久,便和几位山东人,搭乘了由日本向青岛的轮船。”
　　陈干发书至各地党人请其来会,聘任的教员有浙江省的陶成章、湖南省的陈汉元、山西省的景定成、保定的商震、曹州的吕秀文、王鸣双等。震旦公学聘请张继、商震等任政治教员,主持革命活动。学校注重对学生进行国民的精神教育,灌输“驱除鞑虏,恢复中华”的反清思想,激发爱国情感。
　　教程首当军事,次之国文,再次德英日外国语文学,及各类科学。陶成章、景定成、李次元、韩蔚斋任国学教员；吕秀文、商震、王鸣双担任军事教育；吕子人、刘溥霖、李曰秋、李佩兰、赵锡九、王虎韬等任军事训练员。上军事课时,教军事的老师上课,其他教师和同学一起操练。操练队伍仍唱那震奋人心的操练军歌。上国学课,担任军事的教师,又和学生一起听讲。学生、教员打成一片。
　　教员多是革命党人,他们无薪资,食用与学生相同,其所募得的资金,皆购买军械以备起事时用。每课暇会至郊外,择幽僻处习射击。学员在教师的启发和教育下,对革命的认识越来越清楚,觉悟也越来越高。于是有不少学员加入了同盟会,并成为山东革命党的骨干分子。
　　在青岛德占区,教育学生除反清外,还强调反帝。组织学生游行示威,抗议德国侵占我路权矿权,要求权力归还。景定成等人还在船坞码头上发动船员罢工。因此,震旦公学创立不久便在社会上产生了很大影响。

震旦公学声势越来越大　朝廷勾结德人进行抑制
　　陈干创办的震旦公学,是同盟会在山东的一个重要机关,是青岛的第一个革命团体。来校学习的学生很多,壮大了同盟会的组织。震旦公学的影响力扩大到整个山东半岛。
　　1908年5月,陈干与高等师范学堂的于洪起等人联络全省学界,成立山东保矿会,组织群众游行示威抵制德货,反对清廷以山东矿藏为抵押向德国发放外债。7月,陈干去北京向外交部呈递电文时指出:“德人背离协定,原定沿胶济铁路三十里内为限采矿,现已展至近二百里……光绪三十四年(1908)七月十二日满限后,德人苟有背离合同之举,即持而作废……”景定成回忆说:“到北京恰遇发起震旦公学陈君明侯为山东争矿,我替他修改一篇文章,驳倒外交当局。陈干说:此电传播海内外,凡关心时局者,无不为山东庆。当时陈干年仅27岁,他以微弱之躯与权贵争论国家外交大事,不能不令晚辈敬佩。”
　　震旦公学的声势越来越壮大,又因保矿事惹怒了胶澳租借地的德国当局,所以清廷借机勾结德人,抑制震旦。1908年12月4日胶澳总督约见陈干至总督府,指责陈干。陈干义正严词地说:“我生为山东人,责无旁贷,必须为山东守疆土。”德人强行令其一个月之内离开青岛。陈干离开之前,愤恨之极,切左臂,留血书致于洪起先生,字大如拳:“干不日出境,震旦公学自将消去,望先生速来青主持一切。”当时于洪起也是山东主盟人之一。陈干被驱逐出青岛,震旦公学被封闭。幸好震旦公学积攒的枪械弹药已先转移,没有造成更大的损失。
　　虽然震旦公学创办不到一年即被查封了,但是它为辛亥革命在山东地区的发展奠定了坚实的思想基础和组织基础。广泛深入地散播了革命火种,培养了一批革命生力军。武昌起义爆发后,以震旦公学为骨干的革命党人又汇聚于青岛,建立秘密的机关,成为沿胶济铁路独立斗争的指挥中心。他们在山东辛亥革命和陈干转战两淮之北伐革命中皆为骨干。