庄龙甲罹患肺病,病情极度恶化。1928年10月10日,他在回药房时被捕。在南流集的刑场上,庄龙甲仍向群众宣传革命,慷慨就义,牟鸿礼作藏头诗向同志们传达了龙甲牺牲的消息。庄龙甲的牺牲、中共潍县县委遭到破坏,使得革命斗争形势更加恶化,党的活动不得不由半公开转入地下,由潍南转入潍北。
龙甲被捕不惧酷刑,被枪杀后断头吊城楼
　　潍县地执委建立后,庄龙甲日夜奔波在城乡各地,凡他走到的地方,处处都得到了群众的支持。在艰苦的斗争中庄龙甲时时刻刻想到的都是革命工作的开展、革命同志的安危,唯独没有想到自己的身体。生活的困苦,昼夜的工作,使他积劳成疾得了肺病,身体渐渐消瘦下来。
　　1928年大柳树暴动失败后,形势急剧恶化,国民党反动派开始直接捕杀共产党人。正当潍县县委带领全县人民与国民党右派展开轰轰烈烈的革命斗争时,庄龙甲的病情极度恶化,不得已接受了县委的决定,到安邱县杞城庄共产党的一处秘密联络点——傅锡泽药房去休息治疗。在那段时间里,潍县县委成员和乡亲们常去看望他,他总是强忍着病痛,仔细地询问工作情况,和同志们一起分析斗争形势,鼓励大家要勇敢机智地去和敌人作坚决的斗争。
　　1928年10月10日上午,庄龙甲到农户中了解当地建立农会的情况,刚回到药房时便遭到逮捕,随即被押送到国民党南流区保卫团团部。敌人用细麻绳拴住龙甲的两个拇指,将他吊在梁上,施以惨无人道的刑罚,但铮铮铁骨的龙甲,毫不畏惧,坚贞不屈。他愤怒而响亮地对敌人高喊:“共产党人不怕死!怕死就不是共产党!”
　　国民党潍县县党部深知庄龙甲在群众中威信极高,他们害怕群众会以各种方式将其营救,便决定在10月12日(农历八月廿九)南流集这天将庄龙甲尽快杀害。当天,听说要杀一个共产党大官,四乡邻村来的人特别多,当敌人荷枪实弹把庄龙甲押解到指定的集市时,庄龙甲抓住机会向赶集的群众做起了宣传:“共产党是领导穷人闹革命的党,只有共产党才能带领穷人摆脱贫困。”然后他昂起头,高喊着“共产党万岁”,从容地走向刑场英勇就义。残暴的敌人用枪打死庄龙甲后,又抢了附近一个正在铡草的农民的铡刀,铡下了庄龙甲的头颅,并将其头颅挂在东关南门的城楼上示众。

藏头诗报牺牲噩耗,朱继周雨夜抢回头颅
　　10月12日,潍县县委委员牟鸿礼去杞城庄向庄龙甲汇报工作,路过南流时听到龙甲罹难的消息,他极力控制住自己悲愤的心情,马上跑到庄家村,在庄鹤云家召开了秘密会议。会上他只和大家谈了当时的形势,布置了任务,并没有把龙甲罹难的噩耗直接告诉大家,怕突然说出来,同志们和亲属承受不了这巨大悲痛的冲击。临走时,他思忖良久留下了一张纸条,纸条上写着:
　　老子英雄儿好汉,
　　庄稼不收年年盼。
　　死而复生精神存,
　　在与不在何必言。
　　南北东西人知晓,
　　流芳百世万古传。
　　牟鸿礼走后,庄鹤云与庄克仁、庄禄海都感觉他的状态有些怪,遂仔细分析起他留下的诗,才发现这是一首藏头诗,每句的头一个字连起来就是:“老庄死在南流”。看到这六个字,三个人大惊失色,刹时屋里寂静无声。少倾,三个人决定派农民协会会长庄峰云马上去南流摸清事情的真相。庄峰云连夜赶到南流后,知道了南流的同志已经把龙甲的遗体掩埋起来了。他跑到龙甲的坟上痛哭一场后在坟前面栽上了一棵小树作标记。
　　朱家坟庄的党员朱继周听说残暴的敌人把龙甲的头割下来挂在了东关南门上示众,他决心豁上性命也得把龙甲的头摘下来。为慎重起见,他先去南门做了侦察,离城门近百米远就看见龙甲的头用一根木杆高高地挂在城门上,几个国民党兵正在严密看守,他一时难以上去,便暂时撤回。回来后,他彻夜未眠,反反复复地琢磨着将要行动的方案。第二天正巧淅淅沥沥下了一天雨,朱继周趁着阴雨的夜晚直奔南门。因为下着小雨,敌人有些麻痹,朱继周趁敌兵都到屋里躲雨的空档,快步爬上城门把龙甲的头摘下来,头也不回地向南奔跑,一气跑出四五里路,看看没有敌人追来,才放慢脚步,找了一处离他村较近的小松树旁,把龙甲的头埋了起来。
　　庄龙甲的牺牲,使中共潍县县委遭到破坏,给潍县的革命斗争造成了很大损失,形势更加恶化,党的活动只得由半公开转入地下,由潍南转入潍北。
　　1928年12月,山东互济会在给党中央写的《山东济难工作报告》中说:“庄龙甲同志,在群众中甚有信仰,而遇难又极其悲惨,被敌人严刑拷打后枪毙,再铡下头示众……一般人对庄同志之勇敢及死难之惨景无不感慨同情。”

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南流建纪念园　缅怀龙甲烈士
　　庄龙甲烈士故居长期以来都是潍坊市革命传统教育的重要基地,是潍坊市重点革命文物保护单位。
　　故居为一座白墙黑瓦的古朴宅院,进入故居,首先映入眼帘的是庄龙甲烈士的塑像,走进故居陈列室,正对着门口的堂屋墙上挂着庄龙甲烈士的遗像,旁边两面墙上挂满了各界人士的题词,还挂着写有“奎文区山后王家小学德育基地”的牌匾,一侧的卧室墙上悬挂着庄龙甲烈士的遗照和他在省立一师与同学的合影。在堂屋和两间卧室的地上,摆满了社会各界敬献的花圈。
　　2007年4月,中共潍坊市坊子区委为作好党的革命传统教育,提出对庄龙甲就义处(南流)做好保护,并提出保护开发意见。潍坊市坊子区坊安街道党工委、办事处2010年决定:在庄龙甲牺牲地南流驻地(今建华村),建立庄龙甲烈士纪念园一处,园内建一纪念亭。
　　该纪念园占地1.3亩,园四周建有围墙,铁艺门口,门口两边镌刻大理石楹联,门的上方“庄龙甲烈士纪念园”几个大字特别醒目。进入园内,排列整齐的展览图片简要介绍了庄龙甲的革命事迹及其壮烈牺牲的情况。园内北面是纪念亭、纪念碑。亭前有庄龙甲烈士石雕半身头像。整个纪念园内,铺设砖面,遍植松柏,使整个纪念园显得庄重肃穆、朴素大方。